Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH2P19022 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH2P19022 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH2P19022 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH2P19022 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH2P19022 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH2P19022 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH2P19022 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH2P19022 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH2P19022 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH2P19022 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH2P19022 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH2P19022 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH2P19022 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH2P19022 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH2P19022 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH2P19022 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH2P19022 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH2P19022 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH2P19022 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH2P19022 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH2P19022 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH2P19022 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH2P19022 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH2P19022 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH2P19022 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH2P19022 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH2P19022 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH2P19022 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH2P19022 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH2P19022 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms