Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN2P17655 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN2P17655 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN2P17655 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN2P17655 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN2P17655 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN2P17655 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAPN2P17655 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN2P17655 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN2P17655 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN2P17655 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN2P17655 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN2P17655 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN2P17655 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN2P17655 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms