Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2P17301 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2P17301 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms