Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL3L1P16619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms