Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2A2P16615 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A2P16615 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms