Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME1P15531 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NME1P15531 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME1P15531 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME1P15531 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME1P15531 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME1P15531 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME1P15531 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME1P15531 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME1P15531 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME1P15531 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME1P15531 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME1P15531 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME1P15531 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME1P15531 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME1P15531 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME1P15531 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME1P15531 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME1P15531 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME1P15531 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME1P15531 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME1P15531 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME1P15531 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME1P15531 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME1P15531 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME1P15531 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME1P15531 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME1P15531 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME1P15531 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME1P15531 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME1P15531 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME1P15531 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME1P15531 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NME1P15531 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME1P15531 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME1P15531 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME1P15531 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME1P15531 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME1P15531 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME1P15531 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME1P15531 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME1P15531 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NME1P15531 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME1P15531 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME1P15531 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms