Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL11A1P12107 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL11A1P12107 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms