Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB1P12018 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms