Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGA3P0DJD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms