Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD2P0DJD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD2P0DJD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms