Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3P09919 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3P09919 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3P09919 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3P09919 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3P09919 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3P09919 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSF3P09919 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3P09919 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3P09919 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3P09919 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3P09919 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3P09919 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3P09919 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3P09919 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3P09919 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3P09919 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3P09919 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms