Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXC6P09630 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC6P09630 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC6P09630 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms