Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MGPP08493 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MGPP08493 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MGPP08493 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MGPP08493 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MGPP08493 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MGPP08493 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MGPP08493 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MGPP08493 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MGPP08493 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MGPP08493 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MGPP08493 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MGPP08493 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MGPP08493 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MGPP08493 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MGPP08493 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MGPP08493 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MGPP08493 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MGPP08493 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MGPP08493 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MGPP08493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MGPP08493 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MGPP08493 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MGPP08493 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MGPP08493 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MGPP08493 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MGPP08493 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MGPP08493 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MGPP08493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms