Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNP07948 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNP07948 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNP07948 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNP07948 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNP07948 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNP07948 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNP07948 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNP07948 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNP07948 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNP07948 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNP07948 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNP07948 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNP07948 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNP07948 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYNP07948 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNP07948 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNP07948 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNP07948 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNP07948 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYNP07948 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYNP07948 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNP07948 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNP07948 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNP07948 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNP07948 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYNP07948 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYNP07948 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYNP07948 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms