Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPSP04118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPSP04118 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPSP04118 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPSP04118 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPSP04118 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPSP04118 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPSP04118 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPSP04118 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPSP04118 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPSP04118 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPSP04118 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPSP04118 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPSP04118 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPSP04118 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPSP04118 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPSP04118 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPSP04118 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPSP04118 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPSP04118 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPSP04118 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPSP04118 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPSP04118 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPSP04118 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPSP04118 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPSP04118 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPSP04118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPSP04118 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPSP04118 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPSP04118 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPSP04118 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPSP04118 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPSP04118 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPSP04118 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms