Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC1P02654 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC1P02654 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC1P02654 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC1P02654 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC1P02654 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC1P02654 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC1P02654 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC1P02654 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC1P02654 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC1P02654 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC1P02654 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC1P02654 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC1P02654 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC1P02654 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC1P02654 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC1P02654 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC1P02654 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC1P02654 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC1P02654 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC1P02654 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC1P02654 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC1P02654 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms