Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GASTP01350 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GASTP01350 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GASTP01350 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GASTP01350 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GASTP01350 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GASTP01350 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GASTP01350 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GASTP01350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GASTP01350 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GASTP01350 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GASTP01350 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GASTP01350 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GASTP01350 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GASTP01350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GASTP01350 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GASTP01350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GASTP01350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GASTP01350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GASTP01350 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GASTP01350 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GASTP01350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GASTP01350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GASTP01350 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GASTP01350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GASTP01350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GASTP01350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms