Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX6O95475 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX6O95475 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX6O95475 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX6O95475 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX6O95475 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX6O95475 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX6O95475 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX6O95475 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX6O95475 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX6O95475 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX6O95475 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIX6O95475 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX6O95475 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX6O95475 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX6O95475 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX6O95475 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIX6O95475 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIX6O95475 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX6O95475 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX6O95475 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX6O95475 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX6O95475 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIX6O95475 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX6O95475 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX6O95475 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX6O95475 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX6O95475 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX6O95475 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX6O95475 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX6O95475 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms