Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG12O94817 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG12O94817 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG12O94817 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG12O94817 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG12O94817 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG12O94817 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG12O94817 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG12O94817 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG12O94817 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG12O94817 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG12O94817 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG12O94817 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG12O94817 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG12O94817 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG12O94817 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG12O94817 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG12O94817 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms