Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNMDO75829 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNMDO75829 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNMDO75829 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNMDO75829 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNMDO75829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNMDO75829 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNMDO75829 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNMDO75829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNMDO75829 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNMDO75829 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNMDO75829 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNMDO75829 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNMDO75829 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNMDO75829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNMDO75829 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNMDO75829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNMDO75829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNMDO75829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNMDO75829 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNMDO75829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNMDO75829 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNMDO75829 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNMDO75829 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNMDO75829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNMDO75829 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNMDO75829 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNMDO75829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNMDO75829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNMDO75829 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNMDO75829 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNMDO75829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNMDO75829 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNMDO75829 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNMDO75829 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNMDO75829 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNMDO75829 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNMDO75829 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNMDO75829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNMDO75829 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNMDO75829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNMDO75829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms