Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REM1O75628 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REM1O75628 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REM1O75628 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REM1O75628 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REM1O75628 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REM1O75628 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REM1O75628 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REM1O75628 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REM1O75628 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REM1O75628 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REM1O75628 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REM1O75628 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REM1O75628 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REM1O75628 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REM1O75628 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REM1O75628 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REM1O75628 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REM1O75628 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REM1O75628 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REM1O75628 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REM1O75628 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REM1O75628 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REM1O75628 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REM1O75628 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REM1O75628 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REM1O75628 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REM1O75628 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REM1O75628 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REM1O75628 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REM1O75628 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REM1O75628 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REM1O75628 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REM1O75628 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REM1O75628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REM1O75628 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REM1O75628 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REM1O75628 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REM1O75628 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REM1O75628 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REM1O75628 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REM1O75628 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REM1O75628 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REM1O75628 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REM1O75628 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REM1O75628 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REM1O75628 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REM1O75628 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REM1O75628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REM1O75628 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REM1O75628 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REM1O75628 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REM1O75628 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REM1O75628 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REM1O75628 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REM1O75628 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REM1O75628 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REM1O75628 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REM1O75628 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REM1O75628 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REM1O75628 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms