Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC22BO75396 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22BO75396 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms