Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK1O75385 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK1O75385 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK1O75385 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK1O75385 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK1O75385 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK1O75385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK1O75385 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK1O75385 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK1O75385 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK1O75385 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK1O75385 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK1O75385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK1O75385 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK1O75385 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK1O75385 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK1O75385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK1O75385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK1O75385 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK1O75385 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK1O75385 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK1O75385 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK1O75385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK1O75385 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms