Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KERAO60938 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KERAO60938 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms