Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM17BO60830 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM17BO60830 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM17BO60830 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM17BO60830 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM17BO60830 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms