Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD3O60568 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD3O60568 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD3O60568 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms