Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B3O60423 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B3O60423 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B3O60423 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B3O60423 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms