Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP9O43818 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP9O43818 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP9O43818 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP9O43818 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP9O43818 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP9O43818 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP9O43818 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP9O43818 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP9O43818 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP9O43818 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP9O43818 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP9O43818 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP9O43818 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP9O43818 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP9O43818 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP9O43818 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP9O43818 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP9O43818 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP9O43818 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP9O43818 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP9O43818 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP9O43818 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP9O43818 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP9O43818 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP9O43818 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP9O43818 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP9O43818 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP9O43818 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP9O43818 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP9O43818 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP9O43818 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP9O43818 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.3 ms