Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A4O43511 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC26A4O43511 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC26A4O43511 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms