Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMTOR5O43504 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMTOR5O43504 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMTOR5O43504 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms