Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHGDHO43175 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHGDHO43175 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms