Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PJA2O43164 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PJA2O43164 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PJA2O43164 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PJA2O43164 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PJA2O43164 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PJA2O43164 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PJA2O43164 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PJA2O43164 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PJA2O43164 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PJA2O43164 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PJA2O43164 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PJA2O43164 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PJA2O43164 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PJA2O43164 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PJA2O43164 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PJA2O43164 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PJA2O43164 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PJA2O43164 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PJA2O43164 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PJA2O43164 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PJA2O43164 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PJA2O43164 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PJA2O43164 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PJA2O43164 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PJA2O43164 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PJA2O43164 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PJA2O43164 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms