Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP8O43159 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP8O43159 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP8O43159 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP8O43159 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP8O43159 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP8O43159 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP8O43159 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP8O43159 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP8O43159 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP8O43159 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP8O43159 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP8O43159 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP8O43159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP8O43159 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP8O43159 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP8O43159 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP8O43159 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP8O43159 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP8O43159 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP8O43159 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP8O43159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP8O43159 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP8O43159 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP8O43159 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP8O43159 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP8O43159 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP8O43159 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP8O43159 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP8O43159 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP8O43159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP8O43159 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP8O43159 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP8O43159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP8O43159 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms