Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
SOCS1O15524 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOCS1O15524 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms