Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC22A1O15245 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms