Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
VGFO15240 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VGFO15240 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VGFO15240 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
VGFO15240 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VGFO15240 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VGFO15240 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VGFO15240 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VGFO15240 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VGFO15240 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VGFO15240 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VGFO15240 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VGFO15240 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VGFO15240 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VGFO15240 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VGFO15240 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VGFO15240 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VGFO15240 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VGFO15240 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VGFO15240 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VGFO15240 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VGFO15240 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
VGFO15240 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
VGFO15240 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VGFO15240 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VGFO15240 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VGFO15240 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VGFO15240 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VGFO15240 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VGFO15240 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VGFO15240 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VGFO15240 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VGFO15240 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VGFO15240 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VGFO15240 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VGFO15240 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VGFO15240 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VGFO15240 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGFO15240 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGFO15240 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGFO15240 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VGFO15240 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VGFO15240 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VGFO15240 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VGFO15240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VGFO15240 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
VGFO15240 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGFO15240 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VGFO15240 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VGFO15240 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
VGFO15240 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VGFO15240 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
VGFO15240 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGFO15240 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms