Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN3O15232 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN3O15232 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN3O15232 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN3O15232 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN3O15232 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN3O15232 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN3O15232 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN3O15232 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN3O15232 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN3O15232 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN3O15232 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN3O15232 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN3O15232 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN3O15232 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN3O15232 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN3O15232 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN3O15232 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN3O15232 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN3O15232 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN3O15232 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN3O15232 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN3O15232 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN3O15232 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MATN3O15232 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN3O15232 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN3O15232 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN3O15232 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN3O15232 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN3O15232 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN3O15232 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN3O15232 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN3O15232 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN3O15232 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN3O15232 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN3O15232 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN3O15232 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN3O15232 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN3O15232 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN3O15232 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN3O15232 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN3O15232 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN3O15232 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN3O15232 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN3O15232 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN3O15232 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN3O15232 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN3O15232 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN3O15232 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN3O15232 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN3O15232 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN3O15232 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms