Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2LO15068 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms