Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOCS6O14544 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOCS6O14544 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms