Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC7O00311 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC7O00311 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC7O00311 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC7O00311 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC7O00311 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC7O00311 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC7O00311 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC7O00311 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC7O00311 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC7O00311 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC7O00311 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC7O00311 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC7O00311 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC7O00311 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC7O00311 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC7O00311 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC7O00311 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC7O00311 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC7O00311 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC7O00311 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC7O00311 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC7O00311 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC7O00311 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC7O00311 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC7O00311 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC7O00311 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC7O00311 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC7O00311 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC7O00311 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC7O00311 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC7O00311 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC7O00311 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC7O00311 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC7O00311 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC7O00311 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC7O00311 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC7O00311 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC7O00311 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC7O00311 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC7O00311 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC7O00311 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC7O00311 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC7O00311 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC7O00311 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC7O00311 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC7O00311 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC7O00311 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC7O00311 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms