Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms