Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3QR89 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
J3QR89 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3QR89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3QR89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3QR89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3QR89 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QR89 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QR89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QR89 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3QR89 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QR89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QR89 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QR89 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QR89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QR89 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QR89 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QR89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QR89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QR89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QR89 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms