Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA8SH3BPF8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms