Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRRT4C9JH25 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT4C9JH25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT4C9JH25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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