Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN25C9JDP6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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