Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPK3BL1B0FP48 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms