Protein–RNA interactions for Protein: A8K979

ERI2, ERI1 exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI2A8K979 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI2A8K979 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERI2A8K979 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERI2A8K979 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERI2A8K979 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms