Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRM3A6NNA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM3A6NNA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms