Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2BA6NLU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM2BA6NLU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms