Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL1A6NKG5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RTL1A6NKG5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
RTL1A6NKG5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTL1A6NKG5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RTL1A6NKG5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL1A6NKG5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms